GATE

Descriere

GATE (Grid Analysis of Time-Series Expression) este o platformă software integrată de calcul pentru analiza și vizualizarea seriilor temporale bio-moleculare cu dimensiuni mari. GATE folosește un algoritm de grupare bazat pe corelație pentru a aranja serii de timp moleculare pe o matrice hexagonală bidimensională și colorează dinamic hexagoane individuale în funcție de nivelul de expresie al componentei moleculare căreia îi sunt alocate, pentru a crea filme animate cu elemente moleculare la nivel de sistem. dinamica de reglementare. Pentru a deduce potențiale mecanisme de control de reglementare din tiparele de corelare, GATE permite, de asemenea, interogarea interactivă a filmelor împotriva unei game largi de seturi de date de cunoștințe anterioare. Filmele GATE pot fi întrerupte și sunt interactive, permițând utilizatorilor să reconstruiască rețele și să efectueze analize de îmbogățire funcțională. Filmele create cu GATE pot fi salvate în format Flash și inserate direct în fișiere de manuscris PDF ca figuri interactive.