CodonCode Aligner

Descriere

CodonCode Aligner este un software ușor de utilizat pentru asamblarea secvenței ADN, alinierea, editarea contig și detectarea mutațiilor. Aligner este compatibil cu Phred-Phrap și acceptă pe deplin scorurile de calitate a secvenței, oferind în același timp o interfață de utilizator familiară, ușor de învățat. Caracteristicile includ secvențe de import din fișiere text, alinierea contig-urilor între ele, păstrând în același timp legăturile către urme, găsirea mutațiilor heterozigote, definirea regiunilor de interes („funcții”), importarea și editarea ansamblurilor generate de Phrap, exportul secvențelor și caracteristicilor, importarea secvențelor din fișierele ABI și SCF, tăiați vector, aliniați la o secvență de referință, analizați inserțiile și ștergerile heterozigote, navigați între caracteristicile definite de utilizator și exportați proiecte de asamblare compatibile cu Consed.