POY

Descriere

POY este un program de analiză filogenetică care acceptă mai multe tipuri de date (de exemplu, morfologie, nucleotide, gene și regiuni ale genelor, cromozomi și genomi întregi). POY este deosebit prin faptul că poate efectua o aliniere adevărată și inferență de filogenie, adică secvențele de intrare nu trebuie să fie prealiniate. Inserările, ștergerile și rearanjamentele pot fi apoi incluse în scorul general al arborelui în cadrul Maximum Parsimony sau în modelul în Maximum Likelihood. O varietate de algoritmi euristici au fost dezvoltați în acest scop și sunt implementați în POY.